Des observations cytologiques plus fines, réalisées afin de classer les chromosomes des 3 espèces ont conduit à établir les 3 caryotypes suivants :
Triticum monococcum
Triticum aestivum
Triticum turgidum
Le caryotype de Triticum monococcum présente toutes les caractéristiques d’un caryotype classique d’une espèce diploïde.
En revanche les caryotypes du blé dur et du blé tendre présentent une originalité.
Celui du blé dur montre deux groupes de 7 chromosomes, désignés par les lettres A et B. Dans chaque groupe, chaque chromosome est représenté en deux exemplaires ce qui est habituel (chromosomes homologues).
Le caryotype du blé tendre montre, outre les deux groupes de chromosomes A et B, un troisième groupe de 7 chromosomes, D.