1. 1) Combien y a t-il d’opsines dans l’espèce humaine et quel est leur rôle ?
   

2. 2) Recherchez la définition de famille multigénique et de gènes homologues.
   

3. 3) En vous aidant de la fiche FT Genigen2.pdf , utilisez Génigen2 pour:
   

4. • Ouvrir dans la banque de séquences le pack famille multigénique Opsines
   

5. • Aligner les séquences des 3 opsines
   

6. • Afficher le tableau de comparaison en % d’identité (faites une capture d’écran)
   

7. • Afficher le phénogramme des 3 Opsines (arbre de parenté génétique)
   

Ces résultats confirment-ils que les opsines sont issues d’une famille multigénique ?

4. 4) En vous aidant de la fiche FT Genigen2.pdf , utilisez Génigen2 pour:
   

5. • traduire les séquences des 3 opsines (à partir du débutde la séq.)
   

6. • Aligner les 3 séquences PRO
   

7. • repérer un groupe de 6 ac. aminés contigus et identiques aux 3 opsines (faites une capture d’écran du secteur concerné et placez les légendes utiles)
   

5. 5) En vous aidant de la fiche FT Genigen2.pdf , utilisez Génigen2 pour:
   

6. • traduire les séquences des opsines M et L (à partir du débutde la séq.)
   

7. • Aligner les  2 séquences PRO
   

8. • repérer un groupe de 4 ac. aminés proches et différents (2+1+1) aux 2 opsines (faites une capture d’écran du secteur concernéet placez les légendes utiles)
   

6. 6) En vous aidant de la fiche Fiche technique Libmol , utilisez LIBMOL  pour afficher les 3 opsines :
   

7. • sur fond noir
   

8. • en forme RUBAN couleur jaune et le RETINAL en forme «Sphères» avec la couleur captée .
   

9. • colorez en rose le groupe de 6 ac. aminés communs aux 3 opsines
   

10. • colorez en rouge le groupe de 4 ac. aminés différents aux opsine M et L
    

Copiez les images dans le document réponse et apportez les légendes nécessaires.

7. 7) En vous aidant de la fiche FT Genigen2.pdf , utilisez Génigen2 pour:
   

8. • Ouvrir dans la banque de séquences le pack Opsine S chez Primates
   

9. • Aligner les séquences
   

10. • Afficher le phénogramme de parenté de l’ Opsine S (arbre de parenté génétique)
    

Ce résultat est-il en accord avec l’arbre phylogénétique des Primates ci-dessous ?

8. 8)  L'horloge moléculaire est une hypothèse selon laquelle les mutations génétiques s'accumulent dans un génome à une vitesse constante. Elle permet ainsi théoriquement, en reliant le taux de mutation des gènes à la différence génétique entre espèces proches, d'établir une échelle chronologique approximative de la divergence de ces espèces.
   

9. •Sachant qu’on estime le taux de mutation dans les gènes de l’opsine à 0,05% par Millions d’années ,
   

10. •Alignez les séquences des gène M et L puis affichez la dissemblance
    

11. •A partir du résultat, calculez la date de séparation des gènes M/L
    

12. •Ce résultat est-il en accord avec les données sur les opsines des Primates et les découvertes de 2010  et les découvertes récentes de paléontologie ?

Les opsines sont une famille de protéines photosensibles que l’on trouve dans la rétine de la plupart des animaux.