RASTOP2

Fiche Technique “RASTOP”

1) La barre MENU:
Fichier / ouvrir : affiche à l’écran la molécule sélectionnée
Fichier / Imprimer : imprime la molécule affichée ou celle qui est sélectionnée
Editer / sélectionner/Expression : même fonction que l’éditeur de commande (cf pictogramme)
Atomes/Représentation/rayon fixe : permet de fixer le diamètre des sphères
Rubans permet d’afficher la molécule en ruban, sous la forme du squelette carboné notamment
Fenêtres/Mosaïque : permet d’afficher plusieurs molécules si plusieurs fichiers ont été ouverts

2) Sélection et choix de la représentation de la partie sélectionnée dans la fenêtre active:

avec l’éditeur de commandes :

* sélectionne l’ensemble des chaînes affichées dans la fenêtre (permet aussi d’annuler toute sélection plus serrée)
*L sélectionne la chaîne L
114 sélectionne l’acide aminé n° 114 de toutes les chaînes
20-75 sélectionne les acides aminés du n°20 au n°75
*L ,*H sélectionne les chaînes L et H
*L and 20-75 sélectionne les acides aminés de 20 à 75 de la chaîne L
Palette de couleurs : permet le choix d’une couleur qui affectera la sélection et une couleur de fond (choisir fond blanc pour l’impression)

avec les pictogrammes de choix:

Sélectionner 1 atome en cliquant dessus

Sélectionner 1 chaîne

Afficher ce qui est sélectionné, recliquer pour revenir à l’affichage standard

avec les pictogrammes « affichage »:

Sphères : afficher la sélection sous forme de sphères

Rubans : afficher la sélection sous la forme d’un ruban

3) Informations sur les molécules:
Le nom des chaînes est donné au bas de l’écran en passant le curseur de souris sur la chaîne (fréquemment H pour chaîne lourde, L pour légère), P ou Y pour les antigènes.Seule la partie terminale des anticorps est modélisée quand il ne s’agit pas de la molécule entière.
Ce qui est affiché correspond à la molécule dont la séquence complète est affichée dans ANAGENE.
ZOOM : shift tenu, bouton gauche de la souris enfoncé, avancer la souris : Zoom avant